Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKAP1Q86WV1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms