Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF554Q86TJ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms