Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM5Q71RC9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms