Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFXL1Q6ZNB6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFXL1Q6ZNB6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms