Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms