Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms