Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HRCT1Q6UXD1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HRCT1Q6UXD1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms