Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUSD1Q6UWL2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms