Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMARCD3Q6STE5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms