Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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