Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC12Q6PEW1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms