Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6P435 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms