Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF544Q6NX49 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms