Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDE2Q6IQ49 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms