Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms