Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL1Q5VZK9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL1Q5VZK9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms