Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD1Q5SYB0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms