Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSL3PQ5NE16 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSL3PQ5NE16 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms