Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMD9Q5K651 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms