Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms