Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3KQ59H18 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms