Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms