Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP28Q4G0W2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms