Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED5Q49AG3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms