Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RNF212Q495C1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF212Q495C1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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