Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms