Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NBPF8Q3BBV2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms