Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms