Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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