Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLPPQ16740 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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