Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms