Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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