Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC18A3Q16572 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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