Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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