Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNA6Q15825 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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