Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIBQ15653 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIBQ15653 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms