Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms