Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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