Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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BRD3Q15059 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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BRD3Q15059 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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BRD3Q15059 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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BRD3Q15059 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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