Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms