Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCAPHQ15003 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCAPHQ15003 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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