Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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