Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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