Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RFTN1Q14699 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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