Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE7AQ13946 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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