Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP1A4Q13733 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP1A4Q13733 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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