Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4AQ13619 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4AQ13619 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4AQ13619 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms