Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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