Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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