Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBB3Q13509 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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TUBB3Q13509 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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TUBB3Q13509 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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